import java.util.Arrays;

public class Array {

public static void main(String[] args) {

// 배열로 값을 여러개 묶어서 저장

String[] strings = new String[5];

System.out.println(Arrays.toString(strings));

int[] intArray = new int[5];

System.out.println(Arrays.toString(intArray));

intArray[0] = 2;

intArray[1] = 3;

intArray[2] = 5;

intArray[3] = 7;

intArray[4] = 11;

System.out.println(intArray[0]);

// intArray.length == 5

for (int i = 0; i < intArray.length; i++){

System.out.println(intArray[i]);

}

int[] arr1 = {1, 2, 3, 4, 5};

// 같은 주소 참

int[] arr2 = arr1;

// deepcopy 새롭게 복사

int[] arr3 = arr1.clone();

// for-each

// 처음에 수행 부분으로 들어갈 때 i는 intArray의 0번 인덱스의 값(원소)을 갖게 되고,

// 그 다음 들어갈 때는 1번 인덱스의 값(원소)을 갖게 되고...

// 이런 식으로 배열의 마지막 값(원소)까지 갖게 됩니다.

for (int i : intArray) {

System.out.println(i);

}

for (double i : intArray) {

System.out.println(i);

}

String[] fruitsArray = new String[5];

fruitsArray[0] = "딸기";

fruitsArray[1] = "당근";

fruitsArray[2] = "수박";

fruitsArray[3] = "참외";

fruitsArray[4] = "메론";

for (String fruit : fruitsArray) {

System.out.println(fruit);

}

// String 배열에 아래와 같이 저장한 후,

String[] remainders = {"Zero", "One", "Two", "Three"};

// remainders[0] = "Zero";

// remainders[1] = "One";

// remainders[2] = "Two";

// remainders[3] = "Three";

int[] intArrayE = new int[30];

// int j = 1001;

for (int i = 0; i < intArrayE.length; i ++) {

intArrayE[i] = 1001 + i;

System.out.println(remainders[intArrayE[i]%4]);

// switch (intArrayE[i] % 4) {

// case 0 :

// System.out.println(remainders[0]);

// break;

// case 1:

// System.out.println(remainders[1]);

// break;

// case 2:

// System.out.println(remainders[2]);

// break;

// case 3:

// System.out.println(remainders[3]);

// break;

// default:

// break;

// }

}

/*

TAGG, CCAG, AGCC가 총 몇 번 등장하는지 세어봅시다.

TAGG가 2번, CCAG가 4번, AGCC가 3번 등장한다면 아래와 같은 출력 값이 나옵니다.

TAGG: 2

CCAG: 4

AGCC: 3

*/

// 문자열의 toCharArray() 메소드(함수)를 사용하면 char[] 배열을 얻을 수 있습니다.

char[] sequence = "abc".toCharArray();

System.out.println(Arrays.toString(sequence));

// 반대로 char[] 배열을 문자열로 바꾸려면 이렇게 하면 됩니다:

String stringFromCharArr = new String(sequence);

System.out.println(stringFromCharArr);

String dna = "GATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCA"

+ "CCACGCCCGGCTAATTTTTATTTATTTATTTAAAGACAGAGTCTCACTCT"

+ "GTCACTCAGGCTAGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAGCCTTG"

+ "ACCTCCCTGGGCTCCGGTGATTTCACCCTCCCAAGTAGCTAGGACTACAG"

+ "GCACATGCCACGACACCCAGCTAATTTTTTATTTTCTGTGAAGTCAAGGT"

+ "CTTGCTACGTTGCCCATGCTGGTATCAAACCCCTGGGCTCAATCAATCCT"

+ "TCCACCTCAGCCTCCCCAAGTATTGGGGTTACAGGCATGAGCTACCACAC"

+ "TCAGCCCTAGCCTACTTGAAACGTGTTCAGAGCATTTAAGTTACCCTACA"

+ "GTTGGGCAAAGTCATCTAACACAAAGCCCTTTTTATAGTAATAAAATGTT"

+ "GTATATCTCATGTGATTTATTGAATATTGTTACTGAAAGTGAGAAACAGC"

+ "ATGGTTGCATGAAAGGAGGCACAGTCGAGCCAGGCACAGCCTGGGCGCAG"

+ "AGCGAGACTCAAAAAAAGAAAAGGCCAGGCGCACTGGCTCACGCCTGTAA"

+ "TCCCAGCATTTCGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGT"

+ "TCAAGACCAGCCTAGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACA"

+ "AAAATTAACCGGGCGTGATGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGA"

+ "GGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCAGGAGGCGGAGGTTGCAGGGAGC"

+ "CAAGATGGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGTGAGACTCCGTC"

+ "TCAGAAAAAAAAGAAAAGAAACGAGGCACAGTCGCATGCACATGTAGTCC"

+ "CAGTTACTTGAGAGGCTAAGGCAGGAGGATCTCTTGAGCCCAAGAGTTTG"

+ "AGTCCAGCCTGAACAACATAGCAAGACATCATCTCTAAAATTTAAAAAAG"

+ "GGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTGGA"

+ "GGTGGGTAGATCACCTGACGTCAGGAGTTGGAAACCAGCCTGGCTAACAT";

// 스트링을 배열로 만든다.

char[] charArray = dna.toCharArray();

// 현재 상태를 담을 current를 만든다.

char[] current = new char[4];

// 값을 저장할 곳

String[] elements = { "TAGG", "CCAG", "AGCC"};

int[] result = new int[3];

for (int i=0; i < charArray.length-3; i++) {

// 갱신해준다.

current[0] = charArray[i];

current[1] = charArray[i+1];

current[2] = charArray[i+2];

current[3] = charArray[i+3];

// current에 담긴 값을 스트링으로 만든다.

String strFromCharArr = new String(current);

for (int j = 0; j < elements.length; j ++) {

if (elements[j].equals(strFromCharArr)) {

result[j] += 1;

}

}

}

for (int i = 0; i < elements.length; i ++ ) {

System.out.println(elements[i]+ ": " + result[i]);

}

}

}